Johanneksen evankeliumille ovat ominaisia pitkät puhe- tai rukousjaksot, joissa vastakkain ovat juutalaiset ja Jeesus. Niissä selvitetään Jeesuksen suhdetta oman kansansa historiaan ja Jeesuksen suhdetta taivaalliseen Isään. Näiden vastakkainasettelujen kieli on tiukkaa ja roolit selkeät. Vuosisatojen aikana Johanneksen tekstejä on käytetty myös juutalaisvastaisuuden perusteluina.